Biologie des génomes

Nos projets de recherche visent à comprendre la biologie des génomes procaryotes et eucaryotes. Nous combinons des approches expérimentales, basées sur la génétique et la génomique, à l'étude quantitative de la structure et de la fonction des génomes, basée sur l’analyse bioinformatique et la modélisation. La biologie des génomes ne peut être appréhendée qu'en prenant en compte à la fois les mécanismes globaux de fonctionnement des génomes et leur histoire évolutive. En particulier, nous étudions les relations entre la réplication de l'ADN, la taille et la division cellulaire, le cycle cellulaire, les taux de mutation, l'adaptation aux changements environnementaux et les mécanismes d'évolution des génomes, en utilisant à la fois des bactéries et des levures comme organismes modèles.

En savoir plus...

  • Synténie et Reconstruction de génomes ancestraux
  • Evolution des profils spatio-temporels de réplication des génomes
  • Caractérisation des mécanismes moléculaires de formation de réarrangements chromosomiques
  • Recherche des déterminants génétiques contrôlant la stabilité des génomes
  • Etude de la diversité génétique naturelle et des variations de la composition en nucléotide des génomes
  • Etude des patrons et des vitesses d'évolution des séquences codant pour les protéines
  • Phylogénie de gènes, de génomes et d'espèces
  • Nous étudions la dynamique du génome par la caractérisation des variations structurelles des chromosomes et des polymorphismes de séquences à différentes échelles, de la cellule aux populations et des souches aux différentes espèces.
  • Nous nous intéressons aux relations entre la réplication/recombinaison et l'évolution du contenu en gène, de l'organisation des gènes le long des chromosomes et de l'évolution des séquences protéiques.
  • Nous recherchons également à caractériser les mécanismes moléculaires responsables de la formation des réarrangements chromosomiques et de la variation de la composition en nucléotide des génomes.

Collaborations

  • IRCAN, Nice France - Gianni Liti
  • Institut Pasteur Paris – Romain Koszul
  • Université de Strasbourg – Joseph Schacherer
  • INRA AgroParisTech, Grigon – Cécile Neuvéglise
  • CNRS Marseille – Bertrand Llorente
  • Isoft, Gif sur Yvette
  • Stowers Institute for Medical Research, Kansas city, USA – Rong Li