Biologie des génomes

Nos projets de recherche visent à comprendre le fonctionnement et l'évolution des génomes eucaryotes. 

Nous combinons une approche expérimentale de génétique moléculaire et génomique fonctionnelle sur différentes espèces de levures à une étude analytique de l'information contenue dans la séquence des génomes nécessitant l'utilisation et le développement d'outils bio-informatiques.

Nous étudions la dynamique du génome par la caractérisation des variations structurelles des chromosomes et des polymorphismes de séquences à différentes échelles, de la cellule aux populations et des souches aux différentes espèces.

Nous nous intéressons aux relations entre la réplication/recombinaison et l'évolution du contenu en gène, de l'organisation des gènes le long des chromosomes et de l'évolution des séquences protéiques.

Nous recherchons également à caractériser les mécanismes moléculaires responsables de la formation des réarrangements chromosomiques et de la variation de la composition en nucléotide des génomes.

En savoir plus...

  • Synténie et Reconstruction de génomes ancestraux
  • Evolution des profils spatio-temporels de réplication des génomes
  • Caractérisation des mécanismes moléculaires de formation de réarrangements chromosomiques
  • Recherche des déterminants génétiques contrôlant la stabilité des génomes
  • Etude de la diversité génétique naturelle et des variations de la composition en nucléotide des génomes
  • Etude des patrons et des vitesses d'évolution des séquences codant pour les protéines
  • Phylogénie de gènes, de génomes et d'espèces
  • Nous étudions la dynamique du génome par la caractérisation des variations structurelles des chromosomes et des polymorphismes de séquences à différentes échelles, de la cellule aux populations et des souches aux différentes espèces.
  • Nous nous intéressons aux relations entre la réplication/recombinaison et l'évolution du contenu en gène, de l'organisation des gènes le long des chromosomes et de l'évolution des séquences protéiques.
  • Nous recherchons également à caractériser les mécanismes moléculaires responsables de la formation des réarrangements chromosomiques et de la variation de la composition en nucléotide des génomes.

Collaborations

  • IRCAN, Nice France - Gianni Liti
  • Institut Pasteur Paris – Romain Koszul
  • Université de Strasbourg – Joseph Schacherer
  • INRA AgroParisTech, Grigon – Cécile Neuvéglise
  • CNRS Marseille – Bertrand Llorente
  • Isoft, Gif sur Yvette
  • Stowers Institute for Medical Research, Kansas city, USA – Rong Li