Biologie Computationnelle et Quantitative

Le LCQB est un laboratoire interdisciplinaire dont les équipes travaillent à l’interface de la biologie et des sciences quantitatives. Il a été créé pour promouvoir le dialogue entre approches expérimentales et théoriques et pour permettre l'émergence de nouvelles questions biologiques et méthodologiques (analyse de données, modélisation de phénomènes).

Nous abordons diverses problématiques liées aux structures et processus biologiques et a leur évolution par : la collecte de mesures expérimentales, la génération in silico de données biologiques qui seraient inaccessibles autrement, le développement de méthodes d’analyse statistique, et la conception de nouveaux algorithmes de prédiction.

  • Bioinformatique : Bioinformatique structurale, phylogénie, bioinformatique des génomes.
  • Statistiques Computationnelles : analyse statistique des données de séquençage, annotation et quantification des transcrits, identification de petits ARN non codants, annotation des variant structurels
  • Physique Théorique : physique statistique et biophysique (matière molle, structures biomoléculaires et leurs interactions, réseaux biologiques, inférence dans les systèmes désordonnés, modèles d’évolution)
  • Génétique et Génomique (levures et diatomées) : transformations nucléaires et manipulations génétiques, génétique directe et inverse, RNAi, génération de données à haut débit (puces à ADN, séquençage), immuno-précipitation de la chromatine et programme de replication
  • Biologie Cellulaire : FACS, élutriation cellulaire, analyse d’imagerie 3D et calcul de distances entre objets, détection FISH de molécules d’ARN, microfluidique.